Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BHMG1C9JSJ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms