Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BHMG1C9JSJ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHMG1C9JSJ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms