Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT52Q9Y366 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT52Q9Y366 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFT52Q9Y366 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFT52Q9Y366 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms