Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms