Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-2Q9UD57 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX1-2Q9UD57 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NKX1-2Q9UD57 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NKX1-2Q9UD57 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms