Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SACSQ9NZJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SACSQ9NZJ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SACSQ9NZJ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms