Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA3Q9NST1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA3Q9NST1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNPLA3Q9NST1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNPLA3Q9NST1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms