Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4AQ9H3S1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA4AQ9H3S1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA4AQ9H3S1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4AQ9H3S1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4AQ9H3S1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4AQ9H3S1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4AQ9H3S1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4AQ9H3S1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms