Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC97Q96F63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC97Q96F63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC97Q96F63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC97Q96F63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC97Q96F63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms