Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2FQ969M7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2FQ969M7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2FQ969M7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2FQ969M7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2FQ969M7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms