Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP9XQ93008 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP9XQ93008 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP9XQ93008 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms