Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms