Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVBPQ8N300 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SVBPQ8N300 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVBPQ8N300 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVBPQ8N300 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms