Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV48

ERI1, 3'-5' exoribonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI1Q8IV48 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERI1Q8IV48 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERI1Q8IV48 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERI1Q8IV48 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERI1Q8IV48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms