Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC190Q86UF4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC190Q86UF4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC190Q86UF4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC190Q86UF4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms