Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRCQ7RTU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
STRCQ7RTU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
STRCQ7RTU9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STRCQ7RTU9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
STRCQ7RTU9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms