Protein–RNA interactions for Protein: Q7LG56

RRM2B, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2BQ7LG56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM2BQ7LG56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRM2BQ7LG56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RRM2BQ7LG56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RRM2BQ7LG56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms