Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 319.18■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 419.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 518.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 518.67■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 218.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MAGI1-206ENST00000468159 972 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 216.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 216.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 416.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-211ENST00000589016 954 ntTSL 215.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-210ENST00000588821 981 ntTSL 215.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 415.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MRFAP1L1-202ENST00000500563 2127 nt14.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 414.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 213.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MTCP1-203ENST00000476116 738 ntTSL 413.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ZNHIT1-203ENST00000485387 2898 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.31e-10■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 LCP1-206ENST00000469227 730 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FCHO2-204ENST00000507345 726 ntTSL 512.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 512.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 312.78□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 412.52□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 412.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 411.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-202ENST00000586451 527 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-215ENST00000590054 1016 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-206ENST00000587868 663 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-208ENST00000588592 602 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-205ENST00000466595 866 ntTSL 311.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-202ENST00000396696 614 ntTSL 211.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SUSD1-201ENST00000355396 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 CCDC159-218ENST00000591260 580 ntTSL 310.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ADAMTS6-205ENST00000464680 2742 ntTSL 510.65□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 VPS25-203ENST00000589520 639 ntTSL 310.27□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 ADAMTS6-206ENST00000470597 2850 ntTSL 1 (best)10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 39.81□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SNRNP40-201ENST00000263694 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.23□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 39.04□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 PPIP5K2-208ENST00000507921 1516 ntTSL 28.99□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 50.1 ms