RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530404.5

TSPAN4-219, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN4, Length 818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-219ENST00000530404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.15■■■■■ 5.94
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TSPAN4-219ENST00000530404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.56■■■■■ 4.72
TSPAN4-219ENST00000530404 NACADO15069 1562 aa44.22■■■■■ 4.67
TSPAN4-219ENST00000530404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.04■■■■■ 4.64
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TSPAN4-219ENST00000530404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.84■■■■■ 4.61
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TSPAN4-219ENST00000530404 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.52■■■■■ 4.56
TSPAN4-219ENST00000530404 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.33■■■■■ 4.53
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TSPAN4-219ENST00000530404 SCRIBQ14160 1630 aa42.79■■■■■ 4.44
TSPAN4-219ENST00000530404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.55■■■■■ 4.4
TSPAN4-219ENST00000530404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.37■■■■■ 4.37
TSPAN4-219ENST00000530404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
TSPAN4-219ENST00000530404 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.15■■■■■ 4.34
TSPAN4-219ENST00000530404 NCAPD3P42695 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
TSPAN4-219ENST00000530404 SMARCA4P51532 1647 aa40.76■■■■■ 4.12
TSPAN4-219ENST00000530404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.7■■■■■ 4.11
TSPAN4-219ENST00000530404 SMARCA2P51531 1590 aa40.59■■■■■ 4.09
TSPAN4-219ENST00000530404 HMGXB3Q12766 1538 aa40.53■■■■■ 4.08
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TSPAN4-219ENST00000530404 CUX2O14529 1486 aa40.28■■■■■ 4.04
TSPAN4-219ENST00000530404 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.27■■■■■ 4.04
TSPAN4-219ENST00000530404 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.24■■■■■ 4.03
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TSPAN4-219ENST00000530404 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.54■■■■□ 3.92
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TSPAN4-219ENST00000530404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
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TSPAN4-219ENST00000530404 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.2■■■■□ 3.87
TSPAN4-219ENST00000530404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.16■■■■□ 3.86
TSPAN4-219ENST00000530404 CFTRP13569 1480 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPAN4-219ENST00000530404 PRDM2Q13029 1718 aa39■■■■□ 3.83
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TSPAN4-219ENST00000530404 TRIM41Q8WV44 630 aa38.58■■■■□ 3.77
TSPAN4-219ENST00000530404 TOPBP1Q92547 1522 aa38.44■■■■□ 3.74
TSPAN4-219ENST00000530404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
TSPAN4-219ENST00000530404 OSCARQ8IYS5 282 aa38.4■■■■□ 3.74
TSPAN4-219ENST00000530404 IFT140Q96RY7 1462 aa38.37■■■■□ 3.73
TSPAN4-219ENST00000530404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.31■■■■□ 3.72
TSPAN4-219ENST00000530404 ABCC8Q09428 1581 aa38.25■■■■□ 3.71
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TSPAN4-219ENST00000530404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.11■■■■□ 3.69
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TSPAN4-219ENST00000530404 CHD1O14646 1710 aa38.07■■■■□ 3.69
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TSPAN4-219ENST00000530404 ARHGEF11O15085 1522 aa37.9■■■■□ 3.66
TSPAN4-219ENST00000530404 SOGA1O94964 1423 aa37.82■■■■□ 3.64
TSPAN4-219ENST00000530404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.82■■■■□ 3.64
TSPAN4-219ENST00000530404 CUX1P39880 1505 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPAN4-219ENST00000530404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TSPAN4-219ENST00000530404 FBLN2P98095 1184 aa37.76■■■■□ 3.64
TSPAN4-219ENST00000530404 WDR97A6NE52 1622 aa37.67■■■■□ 3.62
TSPAN4-219ENST00000530404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.66■■■■□ 3.62
TSPAN4-219ENST00000530404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
TSPAN4-219ENST00000530404 PBRM1Q86U86 1689 aa37.57■■■■□ 3.61
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TSPAN4-219ENST00000530404 GRIN2BQ13224 1484 aa37.49■■■■□ 3.59
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TSPAN4-219ENST00000530404 SYNJ1O43426 1573 aa37.44■■■■□ 3.58
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TSPAN4-219ENST00000530404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.34■■■■□ 3.57
TSPAN4-219ENST00000530404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.26■■■■□ 3.56
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TSPAN4-219ENST00000530404 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
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TSPAN4-219ENST00000530404 SHROOM2Q13796 1616 aa36.81■■■■□ 3.48
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TSPAN4-219ENST00000530404 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.45■■■■□ 3.43
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