Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP47Q6ZTR5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP47Q6ZTR5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP47Q6ZTR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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