Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SOGA3Q5TF21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOGA3Q5TF21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SOGA3Q5TF21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOGA3Q5TF21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOGA3Q5TF21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms