Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF3Q3KNV8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCGF3Q3KNV8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCGF3Q3KNV8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCGF3Q3KNV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1047.2 ms