Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRSF5Q13243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRSF5Q13243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRSF5Q13243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRSF5Q13243 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRSF5Q13243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms