Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 CSAD-219ENST00000498635 585 ntTSL 48.83□□□□□ -11e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-207ENST00000437073 581 ntTSL 48.68□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 TRAF4-208ENST00000469529 788 ntTSL 28.32□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 CSAD-214ENST00000483632 558 ntTSL 47.65□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 PCED1A-206ENST00000487501 712 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC6.29□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-210ENST00000559973 804 ntTSL 34.91□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 ETFA-217ENST00000560816 412 ntTSL 34.89□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 21.5
SRSF9Q13242 HNMT-205ENST00000467390 532 ntTSL 24.78□□□□□ -1.646e-9■■■■□ 21.1
SRSF9Q13242 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.756e-9■■■■□ 21.1
SRSF9Q13242 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.86e-9■■■■□ 21.1
SRSF9Q13242 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 52.42□□□□□ -2.026e-9■■■■□ 21.1
SRSF9Q13242 TNRC6A-203ENST00000450465 3700 ntTSL 25.54□□□□□ -1.522e-8■■■■□ 21.1
SRSF9Q13242 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 215.67■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 315.25■□□□□ 0.034e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-218ENST00000523328 343 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 513.18□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 412.62□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 410.97□□□□□ -0.654e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-220ENST00000524165 458 ntTSL 210.88□□□□□ -0.674e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.794e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.884e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -14e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 47.5□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 46.82□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.364e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-207ENST00000497899 807 ntTSL 1 (best)6.15□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-207ENST00000518528 624 ntTSL 35.54□□□□□ -1.524e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-205ENST00000391874 888 ntTSL 34.79□□□□□ -1.644e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.654e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 ENAH-201ENST00000284563 665 ntTSL 54.36□□□□□ -1.714e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 PVT1-205ENST00000517790 599 ntTSL 24.29□□□□□ -1.724e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SPRY1-204ENST00000507703 1012 ntTSL 218■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SPRY1-206ENST00000515726 849 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 513.62□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 513.25□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 412.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-212ENST00000481126 389 ntTSL 212.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 412.96□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 312.63□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 412.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-206ENST00000461813 587 ntTSL 412.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 411.66□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SPRY1-203ENST00000505319 641 ntTSL 311.36□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 410.91□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 49.72□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-210ENST00000574871 3150 ntTSL 29.15□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SLC25A28-203ENST00000479722 581 ntTSL 29.01□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 MINK1-212ENST00000576037 770 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 AP1G2-234ENST00000557619 1004 ntTSL 28.11□□□□□ -1.114e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 AL355574.1-201ENST00000423793 311 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SLC25A28-202ENST00000434701 1005 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 35.19□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20.8
SRSF9Q13242 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 512.47□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 20.7
SRSF9Q13242 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.273e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-209ENST00000512283 567 ntTSL 411.35□□□□□ -0.593e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.123e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 47.59□□□□□ -1.193e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.23e-10■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.576e-7■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.616e-11■■■■□ 20.4
SRSF9Q13242 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-11■■■■□ 20.4
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