RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-208ENST00000469529 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.55■■■□□ 2.32
TRAF4-208ENST00000469529 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAF4-208ENST00000469529 ABCC9O60706 1549 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAF4-208ENST00000469529 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAF4-208ENST00000469529 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAF4-208ENST00000469529 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAF4-208ENST00000469529 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-208ENST00000469529 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAF4-208ENST00000469529 NACADO15069 1562 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAF4-208ENST00000469529 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.76■■□□□ 1.39
TRAF4-208ENST00000469529 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
TRAF4-208ENST00000469529 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAF4-208ENST00000469529 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAF4-208ENST00000469529 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAF4-208ENST00000469529 SCRIBQ14160 1630 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAF4-208ENST00000469529 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TRAF4-208ENST00000469529 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF4-208ENST00000469529 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF4-208ENST00000469529 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-208ENST00000469529 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAF4-208ENST00000469529 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAF4-208ENST00000469529 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAF4-208ENST00000469529 SMARCA4P51532 1647 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAF4-208ENST00000469529 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAF4-208ENST00000469529 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAF4-208ENST00000469529 SMARCA2P51531 1590 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAF4-208ENST00000469529 NCAPD3P42695 1498 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAF4-208ENST00000469529 WIZO95785 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAF4-208ENST00000469529 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-208ENST00000469529 HMGXB3Q12766 1538 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-208ENST00000469529 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-208ENST00000469529 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAF4-208ENST00000469529 ERCC6Q03468 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAF4-208ENST00000469529 NESP48681 1621 aa21.93■■□□□ 1.1
TRAF4-208ENST00000469529 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-208ENST00000469529 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-208ENST00000469529 CUX2O14529 1486 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-208ENST00000469529 CFTRP13569 1480 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-208ENST00000469529 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF4-208ENST00000469529 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAF4-208ENST00000469529 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.65■■□□□ 1.06
TRAF4-208ENST00000469529 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TRAF4-208ENST00000469529 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 TRIM41Q8WV44 630 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-208ENST00000469529 WDR62O43379 1518 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-208ENST00000469529 PRDM2Q13029 1718 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-208ENST00000469529 ABCC8Q09428 1581 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAF4-208ENST00000469529 TOP2BQ02880 1626 aa21.28■■□□□ 1
TRAF4-208ENST00000469529 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TRAF4-208ENST00000469529 CUX1P39880 1505 aa21.27■■□□□ 1
TRAF4-208ENST00000469529 SYNJ1O43426 1573 aa21.26■□□□□ 0.99
TRAF4-208ENST00000469529 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.22■□□□□ 0.99
TRAF4-208ENST00000469529 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.2■□□□□ 0.98
TRAF4-208ENST00000469529 TOPBP1Q92547 1522 aa21.19■□□□□ 0.98
TRAF4-208ENST00000469529 EEA1Q15075 1411 aa21.1■□□□□ 0.97
TRAF4-208ENST00000469529 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.08■□□□□ 0.97
TRAF4-208ENST00000469529 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
TRAF4-208ENST00000469529 SOGA1O94964 1423 aa21.04■□□□□ 0.96
TRAF4-208ENST00000469529 IFT140Q96RY7 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
TRAF4-208ENST00000469529 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.99■□□□□ 0.95
TRAF4-208ENST00000469529 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.98■□□□□ 0.95
TRAF4-208ENST00000469529 KIF27Q86VH2 1401 aa20.97■□□□□ 0.95
TRAF4-208ENST00000469529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TRAF4-208ENST00000469529 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.94■□□□□ 0.94
TRAF4-208ENST00000469529 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.93■□□□□ 0.94
TRAF4-208ENST00000469529 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TRAF4-208ENST00000469529 IGF1RP08069 1367 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAF4-208ENST00000469529 OSCARQ8IYS5 282 aa20.88■□□□□ 0.93
TRAF4-208ENST00000469529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TRAF4-208ENST00000469529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TRAF4-208ENST00000469529 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.922e-10■■■■■ 80.7
TRAF4-208ENST00000469529 WDR97A6NE52 1622 aa20.81■□□□□ 0.92
TRAF4-208ENST00000469529 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TRAF4-208ENST00000469529 PRXQ9BXM0 1461 aa20.79■□□□□ 0.92
TRAF4-208ENST00000469529 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAF4-208ENST00000469529 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.76■□□□□ 0.91
TRAF4-208ENST00000469529 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAF4-208ENST00000469529 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAF4-208ENST00000469529 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAF4-208ENST00000469529 KIF21BO75037 1637 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAF4-208ENST00000469529 GRIN2BQ13224 1484 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAF4-208ENST00000469529 GOLGA3Q08378 1498 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAF4-208ENST00000469529 FBLN2P98095 1184 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAF4-208ENST00000469529 CHD1O14646 1710 aa20.64■□□□□ 0.9
TRAF4-208ENST00000469529 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.64■□□□□ 0.89
TRAF4-208ENST00000469529 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAF4-208ENST00000469529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAF4-208ENST00000469529 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAF4-208ENST00000469529 CUL7Q14999 1698 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAF4-208ENST00000469529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAF4-208ENST00000469529 PBRM1Q86U86 1689 aa20.52■□□□□ 0.88
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