Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
HMGXB3Q12766 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC45.69■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC45.68■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.63■■■■■ 4.9
HMGXB3Q12766 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
HMGXB3Q12766 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC45.56■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.88
HMGXB3Q12766 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.5■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
HMGXB3Q12766 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC45.43■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
HMGXB3Q12766 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
HMGXB3Q12766 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
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