Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 EAF5YEL018W 840 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 MTC7YEL033W 420 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 KXD1YGL079W 657 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 PEX13YLR191W 1161 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 MSO1YNR049C 633 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 SRL4YPL033C 846 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 PSD1YNL169C 1503 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-BRQ12217 YGL101WYGL101W 648 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YLR379WYLR379W 375 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 BLS1YLR408C 369 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YNL134CYNL134C 1131 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 MFA2YNL145W 117 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YNR025CYNR025C 360 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 ARA1YBR149W 1035 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 DPB2YPR175W 2070 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 TPO4YOR273C 1980 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YGR201CYGR201C 678 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 RHO3YIL118W 696 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PRE7YBL041W 726 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 GPI2YPL076W 843 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 DUO1YGL061C 744 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 MPM1YJL066C 759 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 JNM1YMR294W 1122 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YOL166CYOL166C 339 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PTM1YKL039W 1572 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 GCN5YGR252W 1320 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 HTB1YDR224C 396 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 MMM1YLL006W 1281 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YAL066WYAL066W 309 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 ORM2YLR350W 651 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YOR325WYOR325W 474 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 ERG25YGR060W 930 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PTH1YHR189W 573 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YIL086CYIL086C 309 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PRM5YIL117C 957 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 ROT1YMR200W 771 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 RFM1YOR279C 933 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YLR108CYLR108C 1458 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 ALG3YBL082C 1377 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YDR124WYDR124W 975 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YGR016WYGR016W 573 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 YLL059CYLL059C 507 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PSY3YLR376C 729 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 RRT1YBL048W 312 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 UBP8YMR223W 1416 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-BRQ12217 PCL2YDL127W 927 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 VPS60YDR486C 690 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YGL177WYGL177W 348 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YLR179CYLR179C 606 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 SEC65YML105C 822 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 EFM2YBR271W 1260 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 RAV2YDR202C 1056 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 STE2YFL026W 1296 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YIL168WYIL168W 384 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 URA4YLR420W 1095 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 TIM23YNR017W 669 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YPL136WYPL136W 369 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 PLB1YMR008C 1995 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 ALD4YOR374W 1560 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 UGA4YDL210W 1716 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 HEM3YDL205C 984 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 OCH1YGL038C 1443 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 PPE1YHR075C 1203 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YHR112CYHR112C 1137 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 AIM22YJL046W 1230 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YLR194CYLR194C 765 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 PRP40YKL012W 1752 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YGL214WYGL214W 486 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 MRPL6YHR147C 645 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YLR235CYLR235C 399 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YCR100CYCR100C 951 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 GRX6YDL010W 696 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 PEX19YDL065C 1029 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YDR401WYDR401W 564 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 SPO11YHL022C 1197 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YJL032WYJL032W 315 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 ERP2YAL007C 648 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 IME1YJR094C 1083 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 SAL1YNL083W 1485 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YDL016CYDL016C 303 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 GTO1YGR154C 1071 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 POT1YIL160C 1254 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YIR043CYIR043C 693 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 TRM10YOL093W 882 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YPL162CYPL162C 822 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 YPR147CYPR147C 915 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-BRQ12217 MRPL13YKR006C 795 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YNL194CYNL194C 906 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YOR097CYOR097C 528 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SGA1YIL099W 1650 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YHR177WYHR177W 1362 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 MEK1YOR351C 1494 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 CCT4YDL143W 1587 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YDL026WYDL026W 312 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 DOM34YNL001W 1161 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 SFT2YBL102W 648 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 YOR364WYOR364W 369 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-BRQ12217 CUP9YPL177C 921 nt8.45□□□□□ -1.06
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