Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 PIL1YGR086C 1020 nt6.47□□□□□ -1.37
NIP7Q08962 GNP1YDR508C 1992 nt6.46□□□□□ -1.37
NIP7Q08962 YML079WYML079W 606 nt6.46□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 NSG2YNL156C 900 nt6.46□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 ATP23YNR020C 813 nt6.46□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 BDS1YOL164W 1941 nt6.46□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 ERG24YNL280C 1317 nt6.46□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 YDR327WYDR327W 327 nt6.45□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 TPI1YDR050C 747 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 PIH1YHR034C 1035 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 PAM17YKR065C 594 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 YPL264CYPL264C 1062 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 SDH8YBR269C 417 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 MFG1YDL233W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 CKI1YLR133W 1749 nt6.43□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 UFD1YGR048W 1086 nt6.43□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 YJL213WYJL213W 996 nt6.43□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 YBL111CYBL111C 2004 nt6.43□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 SNA3YJL151C 402 nt6.42□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 CCW12YLR110C 402 nt6.41□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 YML122CYML122C 381 nt6.41□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 PUS7YOR243C 2031 nt6.41□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 DCR2YLR361C 1737 nt6.41□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 GNA1YFL017C 480 nt6.4□□□□□ -1.38
NIP7Q08962 HNM1YGL077C 1692 nt6.39□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YLR173WYLR173W 1827 nt6.39□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 PUP2YGR253C 783 nt6.39□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 PTH2YBL057C 627 nt6.39□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YBL113CYBL113C 2379 nt6.39□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.38□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 ADH6YMR318C 1083 nt6.38□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 HXT9YJL219W 1704 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YPQ2YDR352W 954 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 TRR2YHR106W 1029 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YLR030WYLR030W 792 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 RPR1RPR1 369 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 AFG3YER017C 2286 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 TCB1YOR086C 3561 nt6.37□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 RTG2YGL252C 1767 nt6.36□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 DML1YMR211W 1428 nt6.36□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 CIT2YCR005C 1383 nt6.36□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 LPD1YFL018C 1500 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YER152CYER152C 1332 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 TUB1YML085C 1344 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 MAL31YBR298C 1845 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 PET117YER058W 324 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 GTS1YGL181W 1191 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 PRS4YBL068W 981 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YOR041CYOR041C 432 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 YPL067CYPL067C 597 nt6.35□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 LAT1YNL071W 1449 nt6.34□□□□□ -1.39
NIP7Q08962 UME1YPL139C 1383 nt6.33□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 HOG1YLR113W 1308 nt6.33□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.33□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YPQ1YOL092W 927 nt6.33□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 CST26YBR042C 1194 nt6.33□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 MSS51YLR203C 1311 nt6.32□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YKL147CYKL147C 618 nt6.32□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YOX1YML027W 1158 nt6.32□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 NFS1YCL017C 1494 nt6.31□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YGL260WYGL260W 231 nt6.31□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 LIP5YOR196C 1245 nt6.31□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 CDC23YHR166C 1881 nt6.3□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 MPE1YKL059C 1326 nt6.3□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 SPE4YLR146C 903 nt6.3□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 DPM1YPR183W 804 nt6.3□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 TOP3YLR234W 1971 nt6.29□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YPL247CYPL247C 1572 nt6.29□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 RPL43AYPR043W 279 nt6.29□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 AIM46YHR199C 933 nt6.28□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 CYS3YAL012W 1185 nt6.28□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 YMR074CYMR074C 438 nt6.28□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 MBF1YOR298C-A 456 nt6.28□□□□□ -1.4
NIP7Q08962 GCD11YER025W 1584 nt6.27□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 CDC7YDL017W 1524 nt6.27□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 RTC4YNL254C 1206 nt6.27□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 RDR1YOR380W 1641 nt6.27□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 BEM1YBR200W 1656 nt6.26□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 COS10YNR075W 1125 nt6.26□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 GET4YOR164C 939 nt6.26□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 PRC1YMR297W 1599 nt6.26□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 CAN1YEL063C 1773 nt6.26□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 AIM34YMR003W 597 nt6.25□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 Q0010Q0010 387 nt6.25□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 YPR130CYPR130C 408 nt6.24□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 snR30snR30 606 nt6.24□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 URA1YKL216W 945 nt6.23□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.22□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 PGI1YBR196C 1665 nt6.22□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 PLB2YMR006C 2121 nt6.22□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 NAF1YNL124W 1479 nt6.22□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 ITR1YDR497C 1755 nt6.21□□□□□ -1.41
NIP7Q08962 CIA1YDR267C 993 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 PDA1YER178W 1263 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 ERG27YLR100W 1044 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 YLR162WYLR162W 357 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 ECM10YEL030W 1935 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 FLC2YAL053W 2352 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 MHP1YJL042W 4197 nt6.21□□□□□ -1.42
NIP7Q08962 DMC1YER179W 1005 nt6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.6 ms