Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 MOB1YIL106W 945 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 NMD4YLR363C 657 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 MRP7YNL005C 1116 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 POS5YPL188W 1245 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 AME1YBR211C 975 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 RTG2YGL252C 1767 nt7.48□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 YPL245WYPL245W 1365 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 SWM1YDR260C 513 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 MSO1YNR049C 633 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 GLE1YDL207W 1617 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 HBS1YKR084C 1836 nt7.47□□□□□ -1.21
HDA2Q06629 RTN1YDR233C 888 nt7.46□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 RRP46YGR095C 672 nt7.46□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 STD1YOR047C 1335 nt7.46□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 ADE2YOR128C 1716 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 LYS20YDL182W 1287 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 SPO12YHR152W 522 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 CYC3YAL039C 810 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 ADD66YKL206C 804 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 UBC12YLR306W 567 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 GDA1YEL042W 1557 nt7.45□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 snR57snR57 88 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 SRP102YKL154W 735 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 PEX22YAL055W 543 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 MRS4YKR052C 915 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 MET30YIL046W 1923 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 AAT1YKL106W 1356 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 HER2YMR293C 1395 nt7.44□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 RKM4YDR257C 1485 nt7.43□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 SER2YGR208W 930 nt7.43□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 OMA1YKR087C 1038 nt7.43□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 RPN5YDL147W 1338 nt7.43□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 ENO1YGR254W 1314 nt7.43□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YGL235WYGL235W 537 nt7.42□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 CBT1YKL208W 816 nt7.42□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YNL190WYNL190W 615 nt7.42□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YOR169CYOR169C 465 nt7.42□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YIR043CYIR043C 693 nt7.41□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 RSM7YJR113C 744 nt7.41□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 GCD11YER025W 1584 nt7.41□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YJL045WYJL045W 1905 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YFR020WYFR020W 699 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 YGR066CYGR066C 879 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 INM1YHR046C 888 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 TSR3YOR006C 942 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 HEM15YOR176W 1182 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 CLD1YGR110W 1338 nt7.4□□□□□ -1.22
HDA2Q06629 PAP1YKR002W 1707 nt7.4□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 CNM67YNL225C 1746 nt7.4□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 DRS1YLL008W 2259 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 GFA1YKL104C 2154 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 ERO1YML130C 1692 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 RAM1YDL090C 1296 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 COX3Q0275 810 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 BUD20YLR074C 501 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 VTA1YLR181C 993 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 RFA2YNL312W 822 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 RRP40YOL142W 723 nt7.39□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 HTS1YPR033C 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 TRP2YER090W 1524 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YDL157CYDL157C 357 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 EMC3YKL207W 762 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YLR280CYLR280C 351 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 PPA2YMR267W 933 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 ECM2YBR065C 1095 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 TIP41YPR040W 1071 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 PEX34YCL056C 435 nt7.38□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 BSC5YNR069C 1470 nt7.37□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YJL009WYJL009W 327 nt7.37□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 ARC19YKL013C 516 nt7.37□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 HST2YPL015C 1074 nt7.37□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 FET5YFL041W 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 TMS1YDR105C 1422 nt7.36□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 CTF18YMR078C 2226 nt7.36□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 MPS2YGL075C 1164 nt7.36□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 YMR007WYMR007W 381 nt7.36□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 POX1YGL205W 2247 nt7.35□□□□□ -1.23
HDA2Q06629 GTO1YGR154C 1071 nt7.35□□□□□ -1.23
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