Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1DQ01668 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1DQ01668 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1DQ01668 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms