Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 SOD2YHR008C 702 nt7.13□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 YOR012WYOR012W 414 nt7.13□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 SMC5YOL034W 3282 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 HSM3YBR272C 1443 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 ENO1YGR254W 1314 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 MOB1YIL106W 945 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 AIM2YAL049C 741 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 SKY1YMR216C 2229 nt7.12□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 CIR2YOR356W 1896 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 YFR020WYFR020W 699 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 SNF4YGL115W 969 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 CHS7YHR142W 951 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 RNA170RNA170 169 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 OLA1YBR025C 1185 nt7.11□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 CLN1YMR199W 1641 nt7.1□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 MAK32YCR019W 1092 nt7.1□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 TPI1YDR050C 747 nt7.1□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 EHD3YDR036C 1503 nt7.1□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 YEN1YER041W 2280 nt7.1□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 MSS51YLR203C 1311 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 SHO1YER118C 1104 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 FAF1YIL019W 1041 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 CYC3YAL039C 810 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 LOT6YLR011W 576 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 RSP5YER125W 2430 nt7.09□□□□□ -1.27
CIK1Q01649 GFA1YKL104C 2154 nt7.08□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 YCR041WYCR041W 333 nt7.08□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 RTC2YBR147W 891 nt7.08□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 PDC6YGR087C 1692 nt7.08□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 HNM1YGL077C 1692 nt7.07□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.07□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 SRP102YKL154W 735 nt7.07□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 PET10YKR046C 852 nt7.07□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 SMK1YPR054W 1167 nt7.07□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 SER2YGR208W 930 nt7.06□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 YBR226CYBR226C 411 nt7.06□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 YPL277CYPL277C 1464 nt7.05□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 PUP3YER094C 618 nt7.05□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 MET22YOL064C 1074 nt7.05□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 HXT8YJL214W 1710 nt7.04□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 AOS1YPR180W 1044 nt7.04□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 COG1YGL223C 1254 nt7.03□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 HAM1YJR069C 594 nt7.03□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 HMS2YJR147W 1077 nt7.03□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 YLR112WYLR112W 420 nt7.03□□□□□ -1.28
CIK1Q01649 VPS65YLR322W 315 nt7.02□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YMR007WYMR007W 381 nt7.02□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 FCY2YER056C 1602 nt7.01□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YLR280CYLR280C 351 nt7.01□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 RHO1YPR165W 630 nt7.01□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 HTS1YPR033C 1641 nt7.01□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 GRH1YDR517W 1119 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YHR033WYHR033W 1272 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 TPK1YJL164C 1194 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 CAR2YLR438W 1275 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YNL017CYNL017C 339 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 ERO1YML130C 1692 nt7□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 HGH1YGR187C 1185 nt6.99□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 ATP4YPL078C 735 nt6.99□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 GPA1YHR005C 1419 nt6.99□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YOS9YDR057W 1629 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 FPR2YDR519W 408 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 RMA1YKL132C 1293 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 PRY2YKR013W 990 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 CDC16YKL022C 2523 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 SNU71YGR013W 1863 nt6.98□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YDR327WYDR327W 327 nt6.97□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YGL260WYGL260W 231 nt6.97□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 RRP46YGR095C 672 nt6.97□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 RCR1YBR005W 642 nt6.97□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 SHC1YER096W 1539 nt6.96□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 ASN2YGR124W 1719 nt6.96□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 THI73YLR004C 1572 nt6.96□□□□□ -1.29
CIK1Q01649 YDR215CYDR215C 414 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 GTT3YEL017W 1014 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YIP4YGL198W 708 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YGR210CYGR210C 1236 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 MNN9YPL050C 1188 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 SGE1YPR198W 1632 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 KDX1YKL161C 1302 nt6.96□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 GDA1YEL042W 1557 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 VMA2YBR127C 1554 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 CYB2YML054C 1776 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YKL147CYKL147C 618 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 BUD20YLR074C 501 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 CDC3YLR314C 1563 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 PRP2YNR011C 2631 nt6.95□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 NUP57YGR119C 1626 nt6.94□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 NTG1YAL015C 1200 nt6.94□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 POX1YGL205W 2247 nt6.94□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 NUP84YDL116W 2181 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 OCH1YGL038C 1443 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 DST1YGL043W 930 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 BXI1YNL305C 894 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YAH1YPL252C 519 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 RGT2YDL138W 2292 nt6.93□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 CTF8YHR191C 402 nt6.92□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 YMR166CYMR166C 1107 nt6.92□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 PRE10YOR362C 867 nt6.92□□□□□ -1.3
CIK1Q01649 NOG2YNR053C 1461 nt6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms