Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAP1Q01518 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAP1Q01518 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAP1Q01518 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CAP1Q01518 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAP1Q01518 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CAP1Q01518 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CAP1Q01518 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms