Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOX10P56693 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOX10P56693 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOX10P56693 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SOX10P56693 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOX10P56693 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOX10P56693 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SOX10P56693 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOX10P56693 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOX10P56693 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOX10P56693 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOX10P56693 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOX10P56693 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SOX10P56693 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX10P56693 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX10P56693 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX10P56693 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX10P56693 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX10P56693 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX10P56693 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX10P56693 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX10P56693 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX10P56693 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX10P56693 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOX10P56693 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOX10P56693 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOX10P56693 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOX10P56693 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOX10P56693 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOX10P56693 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOX10P56693 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOX10P56693 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOX10P56693 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SOX10P56693 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOX10P56693 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOX10P56693 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOX10P56693 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOX10P56693 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SOX10P56693 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOX10P56693 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOX10P56693 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOX10P56693 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOX10P56693 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SOX10P56693 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX10P56693 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX10P56693 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX10P56693 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOX10P56693 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOX10P56693 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOX10P56693 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOX10P56693 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOX10P56693 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX10P56693 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOX10P56693 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOX10P56693 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOX10P56693 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOX10P56693 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOX10P56693 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SOX10P56693 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SOX10P56693 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOX10P56693 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SOX10P56693 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX10P56693 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX10P56693 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX10P56693 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX10P56693 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX10P56693 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SOX10P56693 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SOX10P56693 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SOX10P56693 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX10P56693 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX10P56693 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX10P56693 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms