Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF8P32971 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF8P32971 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF8P32971 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF8P32971 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF8P32971 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF8P32971 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF8P32971 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms