Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXD11P31277 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXD11P31277 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXD11P31277 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD11P31277 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms