Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
TRHP20396 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
TRHP20396 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
TRHP20396 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
TRHP20396 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
TRHP20396 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
TRHP20396 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TRHP20396 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
TRHP20396 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TRHP20396 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
TRHP20396 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRHP20396 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRHP20396 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TRHP20396 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TRHP20396 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TRHP20396 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TRHP20396 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
TRHP20396 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TRHP20396 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TRHP20396 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TRHP20396 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRHP20396 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
TRHP20396 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRHP20396 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRHP20396 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
TRHP20396 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRHP20396 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRHP20396 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRHP20396 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRHP20396 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRHP20396 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRHP20396 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TRHP20396 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TRHP20396 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TRHP20396 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRHP20396 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRHP20396 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRHP20396 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRHP20396 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
TRHP20396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRHP20396 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRHP20396 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRHP20396 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRHP20396 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRHP20396 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRHP20396 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRHP20396 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRHP20396 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRHP20396 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRHP20396 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRHP20396 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TRHP20396 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TRHP20396 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TRHP20396 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TRHP20396 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TRHP20396 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TRHP20396 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
TRHP20396 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
TRHP20396 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRHP20396 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TRHP20396 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TRHP20396 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TRHP20396 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRHP20396 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRHP20396 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRHP20396 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRHP20396 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TRHP20396 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TRHP20396 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TRHP20396 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRHP20396 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRHP20396 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRHP20396 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TRHP20396 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
TRHP20396 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TRHP20396 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TRHP20396 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TRHP20396 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TRHP20396 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TRHP20396 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TRHP20396 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRHP20396 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TRHP20396 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
TRHP20396 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRHP20396 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TRHP20396 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TRHP20396 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
TRHP20396 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRHP20396 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TRHP20396 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms