Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHN1P15882 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHN1P15882 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHN1P15882 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHN1P15882 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHN1P15882 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHN1P15882 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHN1P15882 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN1P15882 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN1P15882 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN1P15882 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHN1P15882 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHN1P15882 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHN1P15882 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHN1P15882 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHN1P15882 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN1P15882 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN1P15882 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN1P15882 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN1P15882 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHN1P15882 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHN1P15882 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHN1P15882 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN1P15882 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN1P15882 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHN1P15882 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHN1P15882 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHN1P15882 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN1P15882 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN1P15882 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN1P15882 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN1P15882 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN1P15882 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHN1P15882 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHN1P15882 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHN1P15882 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHN1P15882 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHN1P15882 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHN1P15882 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHN1P15882 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHN1P15882 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHN1P15882 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHN1P15882 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHN1P15882 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN1P15882 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN1P15882 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN1P15882 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHN1P15882 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHN1P15882 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHN1P15882 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHN1P15882 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHN1P15882 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN1P15882 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHN1P15882 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHN1P15882 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms