Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKP06307 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKP06307 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKP06307 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKP06307 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKP06307 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKP06307 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKP06307 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKP06307 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKP06307 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKP06307 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCKP06307 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCKP06307 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCKP06307 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCKP06307 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCKP06307 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCKP06307 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCKP06307 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKP06307 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKP06307 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKP06307 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKP06307 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCKP06307 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCKP06307 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCKP06307 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCKP06307 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKP06307 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKP06307 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCKP06307 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKP06307 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKP06307 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCKP06307 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKP06307 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms