Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTA1P02549 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTA1P02549 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTA1P02549 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTA1P02549 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms