Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1O95476 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTDNEP1O95476 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTDNEP1O95476 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDNEP1O95476 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms