Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG12O94817 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG12O94817 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG12O94817 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG12O94817 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG12O94817 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG12O94817 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG12O94817 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG12O94817 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG12O94817 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG12O94817 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG12O94817 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG12O94817 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG12O94817 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATG12O94817 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG12O94817 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG12O94817 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG12O94817 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG12O94817 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG12O94817 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG12O94817 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG12O94817 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG12O94817 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG12O94817 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG12O94817 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG12O94817 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG12O94817 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG12O94817 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG12O94817 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG12O94817 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG12O94817 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG12O94817 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG12O94817 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG12O94817 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG12O94817 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG12O94817 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG12O94817 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG12O94817 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG12O94817 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG12O94817 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms