Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF13O43567 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF13O43567 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF13O43567 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF13O43567 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF13O43567 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF13O43567 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF13O43567 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF13O43567 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF13O43567 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF13O43567 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF13O43567 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF13O43567 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF13O43567 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF13O43567 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF13O43567 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF13O43567 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF13O43567 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF13O43567 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF13O43567 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF13O43567 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF13O43567 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF13O43567 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF13O43567 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF13O43567 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF13O43567 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF13O43567 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF13O43567 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF13O43567 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF13O43567 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF13O43567 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF13O43567 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF13O43567 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF13O43567 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF13O43567 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF13O43567 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF13O43567 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF13O43567 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF13O43567 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF13O43567 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF13O43567 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF13O43567 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF13O43567 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF13O43567 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF13O43567 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms