Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTIFO43310 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTIFO43310 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTIFO43310 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTIFO43310 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTIFO43310 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTIFO43310 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTIFO43310 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTIFO43310 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTIFO43310 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTIFO43310 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTIFO43310 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTIFO43310 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTIFO43310 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTIFO43310 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTIFO43310 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTIFO43310 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTIFO43310 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTIFO43310 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTIFO43310 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTIFO43310 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTIFO43310 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTIFO43310 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTIFO43310 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTIFO43310 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTIFO43310 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTIFO43310 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTIFO43310 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTIFO43310 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTIFO43310 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTIFO43310 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTIFO43310 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTIFO43310 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTIFO43310 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTIFO43310 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTIFO43310 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTIFO43310 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTIFO43310 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTIFO43310 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTIFO43310 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTIFO43310 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTIFO43310 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTIFO43310 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTIFO43310 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTIFO43310 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTIFO43310 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTIFO43310 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTIFO43310 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTIFO43310 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTIFO43310 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTIFO43310 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTIFO43310 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTIFO43310 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTIFO43310 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTIFO43310 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTIFO43310 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTIFO43310 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTIFO43310 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTIFO43310 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTIFO43310 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTIFO43310 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTIFO43310 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTIFO43310 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTIFO43310 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTIFO43310 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTIFO43310 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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