Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CHD1O14646 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CHD1O14646 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CHD1O14646 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CHD1O14646 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CHD1O14646 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CHD1O14646 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHD1O14646 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHD1O14646 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHD1O14646 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CHD1O14646 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHD1O14646 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHD1O14646 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHD1O14646 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CHD1O14646 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHD1O14646 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CHD1O14646 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CHD1O14646 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CHD1O14646 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CHD1O14646 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHD1O14646 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHD1O14646 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHD1O14646 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CHD1O14646 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CHD1O14646 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CHD1O14646 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHD1O14646 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHD1O14646 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHD1O14646 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CHD1O14646 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CHD1O14646 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CHD1O14646 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CHD1O14646 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CHD1O14646 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CHD1O14646 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
CHD1O14646 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CHD1O14646 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHD1O14646 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHD1O14646 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHD1O14646 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CHD1O14646 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CHD1O14646 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
CHD1O14646 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CHD1O14646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CHD1O14646 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CHD1O14646 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CHD1O14646 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CHD1O14646 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CHD1O14646 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHD1O14646 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CHD1O14646 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHD1O14646 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHD1O14646 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHD1O14646 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHD1O14646 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CHD1O14646 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CHD1O14646 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CHD1O14646 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHD1O14646 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CHD1O14646 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CHD1O14646 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CHD1O14646 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHD1O14646 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CHD1O14646 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHD1O14646 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CHD1O14646 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
CHD1O14646 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHD1O14646 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHD1O14646 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CHD1O14646 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CHD1O14646 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHD1O14646 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHD1O14646 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CHD1O14646 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CHD1O14646 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CHD1O14646 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CHD1O14646 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHD1O14646 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CHD1O14646 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CHD1O14646 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CHD1O14646 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CHD1O14646 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHD1O14646 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHD1O14646 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
CHD1O14646 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CHD1O14646 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CHD1O14646 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
CHD1O14646 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
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