Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf58C9J3I9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C5orf58C9J3I9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C5orf58C9J3I9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C5orf58C9J3I9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C5orf58C9J3I9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C5orf58C9J3I9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms