RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0142Q0142 PTC4P38089 393 aa13.33□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 YEL023CP39992 682 aa13.32□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 RCR1P38212 213 aa13.31□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 TFA1P36100 482 aa13.29□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 VRP1P37370 817 aa13.28□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 XDJ1P39102 459 aa13.28□□□□□ -0.28
Q0142Q0142 MGA2P40578 1113 aa13.25□□□□□ -0.29
Q0142Q0142 YDR344CQ05510 147 aa13.23□□□□□ -0.29
Q0142Q0142 DPS1P04802 557 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Q0142Q0142 ELP4Q02884 456 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Q0142Q0142 PML39Q03760 334 aa13.1□□□□□ -0.31
Q0142Q0142 RGA2Q06407 1009 aa12.98□□□□□ -0.33
Q0142Q0142 GRE2Q12068 342 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Q0142Q0142 ARH1P48360 493 aa12.92□□□□□ -0.34
Q0142Q0142 MID1P41821 548 aa12.85□□□□□ -0.35
Q0142Q0142 SRC1Q03707 834 aa12.84□□□□□ -0.35
Q0142Q0142 SPT23P35210 1082 aa12.78□□□□□ -0.36
Q0142Q0142 ATH1P48016 1211 aa12.78□□□□□ -0.36
Q0142Q0142 GUT1P32190 709 aa12.76□□□□□ -0.37
Q0142Q0142 MIF2P35201 549 aa12.74□□□□□ -0.37
Q0142Q0142 NST1P53935 1240 aa12.74□□□□□ -0.37
Q0142Q0142 RGA1P39083 1007 aa12.72□□□□□ -0.37
Q0142Q0142 PEX29Q03370 554 aa12.71□□□□□ -0.37
Q0142Q0142 PTC3P34221 468 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Q0142Q0142 EDS1P38073 919 aa12.68□□□□□ -0.38
Q0142Q0142 HAP5Q02516 242 aa12.65□□□□□ -0.38
Q0142Q0142 SOL3P38858 249 aa12.63□□□□□ -0.39
Q0142Q0142 MAK11P20484 414 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Q0142Q0142 BNI4P53858 892 aa12.59□□□□□ -0.39
Q0142Q0142 MPH3P0CE00 602 aa12.58□□□□□ -0.4
Q0142Q0142 AI4P03878 556 aa12.57□□□□□ -0.4
Q0142Q0142 YML082WQ04533 649 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
Q0142Q0142 PTC2P39966 464 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
Q0142Q0142 ILV3P39522 585 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Q0142Q0142 RAM2P29703 316 aa12.48□□□□□ -0.41
Q0142Q0142 MPC54Q08550 464 aa12.46□□□□□ -0.41
Q0142Q0142 RAS1P01119 309 aa12.44□□□□□ -0.42
Q0142Q0142 COQ8P27697 501 aa12.44□□□□□ -0.42
Q0142Q0142 NMA111P53920 997 aa12.37□□□□□ -0.43
Q0142Q0142 YGR273CP53329 174 aa12.3□□□□□ -0.44
Q0142Q0142 YPR015CQ12531 247 aa12.28□□□□□ -0.44
Q0142Q0142 SLI15P38283 698 aa12.24□□□□□ -0.45
Q0142Q0142 DPL1Q05567 589 aa12.24□□□□□ -0.45
Q0142Q0142 TRK1P12685 1235 aa12.21□□□□□ -0.45
Q0142Q0142 RAM1P22007 431 aa12.17□□□□□ -0.46
Q0142Q0142 AMS1P22855 1083 aa12.17□□□□□ -0.46
Q0142Q0142 GYP1Q08484 637 aa12.12□□□□□ -0.47
Q0142Q0142 NOP53Q12080 455 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Q0142Q0142 ISU2Q12056 156 aa12.07□□□□□ -0.48
Q0142Q0142 SDH2P21801 266 aa12.02□□□□□ -0.49
Q0142Q0142 YPL062WQ02781 134 aa11.98□□□□□ -0.49
Q0142Q0142 CDC73Q06697 393 aa11.96□□□□□ -0.49
Q0142Q0142 KEX1P09620 729 aa11.95□□□□□ -0.5
Q0142Q0142 PDR1P12383 1068 aa11.95□□□□□ -0.5
Q0142Q0142 SAS4Q04003 481 aa11.94□□□□□ -0.5
Q0142Q0142 YEL077CQ3E7X8 1277 aa11.88□□□□□ -0.51
Q0142Q0142 MRF1P30775 413 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
Q0142Q0142 YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Q0142Q0142 BRE2P43132 505 aa11.7□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 UBP14P38237 781 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 GAR1P28007 205 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data11.67□□□□□ -0.54not detected
Q0142Q0142 BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 VHR2P40041 505 aa11.65□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 AIR1P40507 360 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Q0142Q0142 PRT1P06103 763 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Q0142Q0142 GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data11.62□□□□□ -0.55not detected
Q0142Q0142 RPP1BP10622 106 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Q0142Q0142 GCR2Q01722 534 aa11.6□□□□□ -0.55
Q0142Q0142 RAD54P32863 898 aa11.59□□□□□ -0.55
Q0142Q0142 CLA4P48562 842 aa11.58□□□□□ -0.56
Q0142Q0142 ERG12P07277 443 aa11.57□□□□□ -0.56
Q0142Q0142 CST6P40535 587 aa11.55□□□□□ -0.56
Q0142Q0142 STR2P47164 639 aa11.55□□□□□ -0.56
Q0142Q0142 YRR1Q12172 810 aa11.54□□□□□ -0.56
Q0142Q0142 ISM1P48526 1002 aa11.5□□□□□ -0.57
Q0142Q0142 PEX21P50091 288 aa11.46□□□□□ -0.57
Q0142Q0142 SET1P38827 1080 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Q0142Q0142 LAM6Q08001 693 aa11.44□□□□□ -0.58
Q0142Q0142 NUD1P32336 851 aa11.41□□□□□ -0.58
Q0142Q0142 MET22P32179 357 aa11.38□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 GAP1P19145 602 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 CDC4P07834 779 aa11.36□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 YDR090CQ03193 310 aa11.36□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 TUM1Q08686 304 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 TFB4Q12004 338 aa11.34□□□□□ -0.59
Q0142Q0142 SPT16P32558 1035 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-DR4O74302 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-AP0CX57 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-PR1P0CX58 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-ORP0CX59 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-PR2P0CX60 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-DR5P0CX65 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-ER2P0CX66 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-GR3P0CX67 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-LR1P0CX68 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 TY1A-MR2P0CX69 440 aa11.32□□□□□ -0.6
Q0142Q0142 NPL4P33755 580 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms