RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638769.1

SZT2-214, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 3

Gene SZT2, Length 307 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-214ENST00000638769 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.24■■■■□ 3.39
SZT2-214ENST00000638769 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.55■■■□□ 2.8
SZT2-214ENST00000638769 ABCC9O60706 1549 aa32.5■■■□□ 2.79
SZT2-214ENST00000638769 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.94■■■□□ 2.54
SZT2-214ENST00000638769 NACADO15069 1562 aa30.75■■■□□ 2.51
SZT2-214ENST00000638769 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.55■■■□□ 2.48
SZT2-214ENST00000638769 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.4■■■□□ 2.46
SZT2-214ENST00000638769 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
SZT2-214ENST00000638769 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.31■■■□□ 2.44
SZT2-214ENST00000638769 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
SZT2-214ENST00000638769 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.12■■■□□ 2.41
SZT2-214ENST00000638769 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SZT2-214ENST00000638769 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.97■■■□□ 2.39
SZT2-214ENST00000638769 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
SZT2-214ENST00000638769 SCRIBQ14160 1630 aa29.6■■■□□ 2.33
SZT2-214ENST00000638769 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.39■■■□□ 2.3
SZT2-214ENST00000638769 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
SZT2-214ENST00000638769 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.28■■■□□ 2.28
SZT2-214ENST00000638769 NCAPD3P42695 1498 aa28.4■■■□□ 2.14
SZT2-214ENST00000638769 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.31■■■□□ 2.12
SZT2-214ENST00000638769 SMARCA4P51532 1647 aa28.28■■■□□ 2.12
SZT2-214ENST00000638769 SMARCA2P51531 1590 aa28.2■■■□□ 2.11
SZT2-214ENST00000638769 HMGXB3Q12766 1538 aa28.2■■■□□ 2.1
SZT2-214ENST00000638769 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SZT2-214ENST00000638769 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.05■■■□□ 2.08
SZT2-214ENST00000638769 CUX2O14529 1486 aa28.04■■■□□ 2.08
SZT2-214ENST00000638769 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.02■■■□□ 2.08
SZT2-214ENST00000638769 ERCC6Q03468 1493 aa28.01■■■□□ 2.07
SZT2-214ENST00000638769 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SZT2-214ENST00000638769 NESP48681 1621 aa27.95■■■□□ 2.06
SZT2-214ENST00000638769 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.93■■■□□ 2.06
SZT2-214ENST00000638769 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.74■■■□□ 2.03
SZT2-214ENST00000638769 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SZT2-214ENST00000638769 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.59■■■□□ 2.01
SZT2-214ENST00000638769 WIZO95785 1651 aa27.59■■■□□ 2.01
SZT2-214ENST00000638769 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.54■■■□□ 2
SZT2-214ENST00000638769 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.5■■□□□ 1.99
SZT2-214ENST00000638769 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SZT2-214ENST00000638769 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.33■■□□□ 1.97
SZT2-214ENST00000638769 WDR62O43379 1518 aa27.31■■□□□ 1.96
SZT2-214ENST00000638769 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SZT2-214ENST00000638769 CFTRP13569 1480 aa27.22■■□□□ 1.95
SZT2-214ENST00000638769 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.2■■□□□ 1.95
SZT2-214ENST00000638769 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.19■■□□□ 1.94
SZT2-214ENST00000638769 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SZT2-214ENST00000638769 PRDM2Q13029 1718 aa26.96■■□□□ 1.91
SZT2-214ENST00000638769 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.93■■□□□ 1.9
SZT2-214ENST00000638769 TOPBP1Q92547 1522 aa26.7■■□□□ 1.86
SZT2-214ENST00000638769 TRIM41Q8WV44 630 aa26.69■■□□□ 1.86
SZT2-214ENST00000638769 OSCARQ8IYS5 282 aa26.68■■□□□ 1.86
SZT2-214ENST00000638769 IFT140Q96RY7 1462 aa26.68■■□□□ 1.86
SZT2-214ENST00000638769 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SZT2-214ENST00000638769 ABCC8Q09428 1581 aa26.59■■□□□ 1.85
SZT2-214ENST00000638769 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.59■■□□□ 1.85
SZT2-214ENST00000638769 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SZT2-214ENST00000638769 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SZT2-214ENST00000638769 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SZT2-214ENST00000638769 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
SZT2-214ENST00000638769 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
SZT2-214ENST00000638769 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.42■■□□□ 1.82
SZT2-214ENST00000638769 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
SZT2-214ENST00000638769 ARHGEF11O15085 1522 aa26.33■■□□□ 1.81
SZT2-214ENST00000638769 CHD1O14646 1710 aa26.32■■□□□ 1.8
SZT2-214ENST00000638769 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.31■■□□□ 1.8
SZT2-214ENST00000638769 SOGA1O94964 1423 aa26.25■■□□□ 1.79
SZT2-214ENST00000638769 CUX1P39880 1505 aa26.24■■□□□ 1.79
SZT2-214ENST00000638769 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.23■■□□□ 1.79
SZT2-214ENST00000638769 WDR97A6NE52 1622 aa26.21■■□□□ 1.79
SZT2-214ENST00000638769 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SZT2-214ENST00000638769 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.12■■□□□ 1.77
SZT2-214ENST00000638769 FBLN2P98095 1184 aa26.1■■□□□ 1.77
SZT2-214ENST00000638769 ARAP1Q96P48 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
SZT2-214ENST00000638769 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SZT2-214ENST00000638769 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.05■■□□□ 1.76
SZT2-214ENST00000638769 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.05■■□□□ 1.76
SZT2-214ENST00000638769 GRIN2BQ13224 1484 aa26.04■■□□□ 1.76
SZT2-214ENST00000638769 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 PBRM1Q86U86 1689 aa25.97■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.97■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 SYNJ2O15056 1496 aa25.97■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 SYNJ1O43426 1573 aa25.96■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.96■■□□□ 1.75
SZT2-214ENST00000638769 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.95■■□□□ 1.74
SZT2-214ENST00000638769 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SZT2-214ENST00000638769 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.83■■□□□ 1.73
SZT2-214ENST00000638769 TOP2BQ02880 1626 aa25.81■■□□□ 1.72
SZT2-214ENST00000638769 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
SZT2-214ENST00000638769 ADAMTS12P58397 1594 aa25.73■■□□□ 1.71
SZT2-214ENST00000638769 GRIN2AQ12879 1464 aa25.72■■□□□ 1.71
SZT2-214ENST00000638769 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SZT2-214ENST00000638769 NUP160Q12769 1436 aa25.68■■□□□ 1.7
SZT2-214ENST00000638769 CEP170Q5SW79 1584 aa25.66■■□□□ 1.7
SZT2-214ENST00000638769 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.64■■□□□ 1.69
SZT2-214ENST00000638769 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.63■■□□□ 1.69
SZT2-214ENST00000638769 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
SZT2-214ENST00000638769 SHROOM2Q13796 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
SZT2-214ENST00000638769 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.38■■□□□ 1.65
SZT2-214ENST00000638769 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SZT2-214ENST00000638769 JPH4Q96JJ6 628 aa25.33■■□□□ 1.65
SZT2-214ENST00000638769 IGF1RP08069 1367 aa25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms