RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637648.1

RNASEH2B-211, Transcript of ribonuclease H2 subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene RNASEH2B, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2B-211ENST00000637648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.79■■■■■ 6.2
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RNASEH2B-211ENST00000637648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.4■■■■■ 4.86
RNASEH2B-211ENST00000637648 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.3■■■■■ 4.84
RNASEH2B-211ENST00000637648 NACADO15069 1562 aa45.21■■■■■ 4.83
RNASEH2B-211ENST00000637648 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.74■■■■■ 4.75
RNASEH2B-211ENST00000637648 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
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RNASEH2B-211ENST00000637648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.44■■■■■ 4.7
RNASEH2B-211ENST00000637648 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.39■■■■■ 4.7
RNASEH2B-211ENST00000637648 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.28■■■■■ 4.68
RNASEH2B-211ENST00000637648 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.16■■■■■ 4.66
RNASEH2B-211ENST00000637648 SCRIBQ14160 1630 aa43.82■■■■■ 4.61
RNASEH2B-211ENST00000637648 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.42■■■■■ 4.54
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RNASEH2B-211ENST00000637648 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.96■■■■■ 4.47
RNASEH2B-211ENST00000637648 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.75■■■■■ 4.43
RNASEH2B-211ENST00000637648 SMARCA4P51532 1647 aa41.83■■■■■ 4.29
RNASEH2B-211ENST00000637648 NCAPD3P42695 1498 aa41.79■■■■■ 4.28
RNASEH2B-211ENST00000637648 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.77■■■■■ 4.28
RNASEH2B-211ENST00000637648 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RNASEH2B-211ENST00000637648 SMARCA2P51531 1590 aa41.59■■■■■ 4.25
RNASEH2B-211ENST00000637648 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.51■■■■■ 4.24
RNASEH2B-211ENST00000637648 HMGXB3Q12766 1538 aa41.47■■■■■ 4.23
RNASEH2B-211ENST00000637648 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.38■■■■■ 4.22
RNASEH2B-211ENST00000637648 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
RNASEH2B-211ENST00000637648 NESP48681 1621 aa41.06■■■■■ 4.16
RNASEH2B-211ENST00000637648 WIZO95785 1651 aa41.03■■■■■ 4.16
RNASEH2B-211ENST00000637648 ERCC6Q03468 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
RNASEH2B-211ENST00000637648 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
RNASEH2B-211ENST00000637648 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.71■■■■■ 4.11
RNASEH2B-211ENST00000637648 CUX2O14529 1486 aa40.65■■■■■ 4.1
RNASEH2B-211ENST00000637648 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.57■■■■■ 4.08
RNASEH2B-211ENST00000637648 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.48■■■■■ 4.07
RNASEH2B-211ENST00000637648 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
RNASEH2B-211ENST00000637648 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.47■■■■■ 4.07
RNASEH2B-211ENST00000637648 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
RNASEH2B-211ENST00000637648 CFTRP13569 1480 aa40.2■■■■■ 4.03
RNASEH2B-211ENST00000637648 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.15■■■■■ 4.02
RNASEH2B-211ENST00000637648 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.11■■■■■ 4.01
RNASEH2B-211ENST00000637648 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.1■■■■■ 4.01
RNASEH2B-211ENST00000637648 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.09■■■■■ 4.01
RNASEH2B-211ENST00000637648 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.05■■■■■ 4
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RNASEH2B-211ENST00000637648 PRDM2Q13029 1718 aa39.74■■■■□ 3.95
RNASEH2B-211ENST00000637648 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
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RNASEH2B-211ENST00000637648 IFT140Q96RY7 1462 aa39.24■■■■□ 3.87
RNASEH2B-211ENST00000637648 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
RNASEH2B-211ENST00000637648 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
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RNASEH2B-211ENST00000637648 SOGA1O94964 1423 aa38.89■■■■□ 3.82
RNASEH2B-211ENST00000637648 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.88■■■■□ 3.81
RNASEH2B-211ENST00000637648 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
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RNASEH2B-211ENST00000637648 FBLN2P98095 1184 aa38.57■■■■□ 3.76
RNASEH2B-211ENST00000637648 CHD1O14646 1710 aa38.56■■■■□ 3.76
RNASEH2B-211ENST00000637648 WDR97A6NE52 1622 aa38.52■■■■□ 3.76
RNASEH2B-211ENST00000637648 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.49■■■■□ 3.75
RNASEH2B-211ENST00000637648 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
RNASEH2B-211ENST00000637648 SYNJ1O43426 1573 aa38.44■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 GRIN2BQ13224 1484 aa38.44■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.43■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 TOP2BQ02880 1626 aa38.41■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.41■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.4■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.4■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.4■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.4■■■■□ 3.74
RNASEH2B-211ENST00000637648 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
RNASEH2B-211ENST00000637648 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
RNASEH2B-211ENST00000637648 ARHGEF11O15085 1522 aa38.33■■■■□ 3.73
RNASEH2B-211ENST00000637648 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.32■■■■□ 3.73
RNASEH2B-211ENST00000637648 PBRM1Q86U86 1689 aa38.31■■■■□ 3.72
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RNASEH2B-211ENST00000637648 ARAP1Q96P48 1450 aa38.01■■■■□ 3.67
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RNASEH2B-211ENST00000637648 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.93■■■■□ 3.66
RNASEH2B-211ENST00000637648 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.92■■■■□ 3.66
RNASEH2B-211ENST00000637648 CEP170Q5SW79 1584 aa37.83■■■■□ 3.65
RNASEH2B-211ENST00000637648 NUP160Q12769 1436 aa37.81■■■■□ 3.64
RNASEH2B-211ENST00000637648 IGF1RP08069 1367 aa37.68■■■■□ 3.62
RNASEH2B-211ENST00000637648 KIF27Q86VH2 1401 aa37.68■■■■□ 3.62
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RNASEH2B-211ENST00000637648 SHROOM2Q13796 1616 aa37.56■■■■□ 3.6
RNASEH2B-211ENST00000637648 JPH4Q96JJ6 628 aa37.49■■■■□ 3.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
RNASEH2B-211ENST00000637648 CUL7Q14999 1698 aa37.45■■■■□ 3.59
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