RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		6.12	□□□□□ -1.43
CACNB4-222	ENST00000636350	MYT1	Q01538	1121 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CACNB4-222	ENST00000636350	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
CACNB4-222	ENST00000636350	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CACNB4-222	ENST00000636350	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CACNB4-222	ENST00000636350	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CACNB4-222	ENST00000636350	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CACNB4-222	ENST00000636350	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CACNB4-222	ENST00000636350	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CACNB4-222	ENST00000636350	HRC	P23327	699 aa		5.21	□□□□□ -1.57
CACNB4-222	ENST00000636350	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CACNB4-222	ENST00000636350	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CACNB4-222	ENST00000636350	EEA1	Q15075	1411 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNB4-222	ENST00000636350	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CACNB4-222	ENST00000636350	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CACNB4-222	ENST00000636350	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CACNB4-222	ENST00000636350	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		5	□□□□□ -1.61
CACNB4-222	ENST00000636350	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	ABCC9	O60706	1549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	NACAD	O15069	1562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-222	ENST00000636350	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	TRIM41	Q8WV44	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-222	ENST00000636350	APLP2	Q06481	763 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-222	ENST00000636350	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-222	ENST00000636350	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CACNB4-222	ENST00000636350	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-222	ENST00000636350	NEFL	P07196	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-222	ENST00000636350	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CACNB4-222	ENST00000636350	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	CEP162	Q5TB80	1403 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	CUX2	O14529	1486 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF21B	O75037	1637 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CACNB4-222	ENST00000636350	CLIP1	P30622	1438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-222	ENST00000636350	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	INSR	P06213	1382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	ANP32C	O43423	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CACNB4-222	ENST00000636350	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	AAMP	Q13685	434 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	CUX1	P39880	1505 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-222	ENST00000636350	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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