RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630217.1

RCAN3-211, Transcript of RCAN family member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RCAN3, Length 658 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3-211ENST00000630217 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.25■■■■■ 4.03
RCAN3-211ENST00000630217 ABCC9O60706 1549 aa36.11■■■■□ 3.37
RCAN3-211ENST00000630217 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.05■■■■□ 3.36
RCAN3-211ENST00000630217 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.34■■■■□ 3.09
RCAN3-211ENST00000630217 NACADO15069 1562 aa34.12■■■■□ 3.05
RCAN3-211ENST00000630217 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34■■■■□ 3.03
RCAN3-211ENST00000630217 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.87■■■■□ 3.01
RCAN3-211ENST00000630217 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.67■■■□□ 2.98
RCAN3-211ENST00000630217 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.64■■■□□ 2.98
RCAN3-211ENST00000630217 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.49■■■□□ 2.95
RCAN3-211ENST00000630217 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
RCAN3-211ENST00000630217 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.34■■■□□ 2.93
RCAN3-211ENST00000630217 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.24■■■□□ 2.91
RCAN3-211ENST00000630217 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
RCAN3-211ENST00000630217 SCRIBQ14160 1630 aa32.88■■■□□ 2.85
RCAN3-211ENST00000630217 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.59■■■□□ 2.81
RCAN3-211ENST00000630217 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
RCAN3-211ENST00000630217 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.53■■■□□ 2.8
RCAN3-211ENST00000630217 NCAPD3P42695 1498 aa31.52■■■□□ 2.64
RCAN3-211ENST00000630217 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.44■■■□□ 2.62
RCAN3-211ENST00000630217 SMARCA4P51532 1647 aa31.37■■■□□ 2.61
RCAN3-211ENST00000630217 SMARCA2P51531 1590 aa31.33■■■□□ 2.61
RCAN3-211ENST00000630217 HMGXB3Q12766 1538 aa31.27■■■□□ 2.6
RCAN3-211ENST00000630217 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
RCAN3-211ENST00000630217 ERCC6Q03468 1493 aa31.18■■■□□ 2.58
RCAN3-211ENST00000630217 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
RCAN3-211ENST00000630217 CUX2O14529 1486 aa31.1■■■□□ 2.57
RCAN3-211ENST00000630217 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.09■■■□□ 2.57
RCAN3-211ENST00000630217 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.07■■■□□ 2.56
RCAN3-211ENST00000630217 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.01■■■□□ 2.56
RCAN3-211ENST00000630217 NESP48681 1621 aa31.01■■■□□ 2.55
RCAN3-211ENST00000630217 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.78■■■□□ 2.52
RCAN3-211ENST00000630217 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
RCAN3-211ENST00000630217 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.64■■■□□ 2.49
RCAN3-211ENST00000630217 WIZO95785 1651 aa30.6■■■□□ 2.49
RCAN3-211ENST00000630217 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.58■■■□□ 2.49
RCAN3-211ENST00000630217 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.55■■■□□ 2.48
RCAN3-211ENST00000630217 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
RCAN3-211ENST00000630217 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.37■■■□□ 2.45
RCAN3-211ENST00000630217 WDR62O43379 1518 aa30.28■■■□□ 2.44
RCAN3-211ENST00000630217 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
RCAN3-211ENST00000630217 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.25■■■□□ 2.43
RCAN3-211ENST00000630217 CFTRP13569 1480 aa30.23■■■□□ 2.43
RCAN3-211ENST00000630217 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.22■■■□□ 2.43
RCAN3-211ENST00000630217 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
RCAN3-211ENST00000630217 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.93■■■□□ 2.38
RCAN3-211ENST00000630217 PRDM2Q13029 1718 aa29.88■■■□□ 2.37
RCAN3-211ENST00000630217 TRIM41Q8WV44 630 aa29.74■■■□□ 2.35
RCAN3-211ENST00000630217 OSCARQ8IYS5 282 aa29.71■■■□□ 2.35
RCAN3-211ENST00000630217 IFT140Q96RY7 1462 aa29.65■■■□□ 2.34
RCAN3-211ENST00000630217 TOPBP1Q92547 1522 aa29.65■■■□□ 2.34
RCAN3-211ENST00000630217 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
RCAN3-211ENST00000630217 ABCC8Q09428 1581 aa29.58■■■□□ 2.33
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RCAN3-211ENST00000630217 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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RCAN3-211ENST00000630217 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.24■■■□□ 2.27
RCAN3-211ENST00000630217 SOGA1O94964 1423 aa29.22■■■□□ 2.27
RCAN3-211ENST00000630217 ARHGEF11O15085 1522 aa29.21■■■□□ 2.27
RCAN3-211ENST00000630217 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RCAN3-211ENST00000630217 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.17■■■□□ 2.26
RCAN3-211ENST00000630217 FBLN2P98095 1184 aa29.16■■■□□ 2.26
RCAN3-211ENST00000630217 CUX1P39880 1505 aa29.14■■■□□ 2.25
RCAN3-211ENST00000630217 CHD1O14646 1710 aa29.14■■■□□ 2.25
RCAN3-211ENST00000630217 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RCAN3-211ENST00000630217 WDR97A6NE52 1622 aa29.05■■■□□ 2.24
RCAN3-211ENST00000630217 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.04■■■□□ 2.24
RCAN3-211ENST00000630217 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.02■■■□□ 2.24
RCAN3-211ENST00000630217 GRIN2BQ13224 1484 aa28.97■■■□□ 2.23
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RCAN3-211ENST00000630217 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
RCAN3-211ENST00000630217 ARAP1Q96P48 1450 aa28.93■■■□□ 2.22
RCAN3-211ENST00000630217 SYNJ2O15056 1496 aa28.86■■■□□ 2.21
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RCAN3-211ENST00000630217 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.86■■■□□ 2.21
RCAN3-211ENST00000630217 SYNJ1O43426 1573 aa28.84■■■□□ 2.21
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RCAN3-211ENST00000630217 PBRM1Q86U86 1689 aa28.77■■■□□ 2.2
RCAN3-211ENST00000630217 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.76■■■□□ 2.2
RCAN3-211ENST00000630217 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
RCAN3-211ENST00000630217 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
RCAN3-211ENST00000630217 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.67■■■□□ 2.18
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RCAN3-211ENST00000630217 GRIN2AQ12879 1464 aa28.59■■■□□ 2.17
RCAN3-211ENST00000630217 ADAMTS12P58397 1594 aa28.55■■■□□ 2.16
RCAN3-211ENST00000630217 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.51■■■□□ 2.15
RCAN3-211ENST00000630217 NUP160Q12769 1436 aa28.5■■■□□ 2.15
RCAN3-211ENST00000630217 CEP170Q5SW79 1584 aa28.46■■■□□ 2.15
RCAN3-211ENST00000630217 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
RCAN3-211ENST00000630217 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.42■■■□□ 2.14
RCAN3-211ENST00000630217 SHROOM2Q13796 1616 aa28.32■■■□□ 2.12
RCAN3-211ENST00000630217 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
RCAN3-211ENST00000630217 JPH4Q96JJ6 628 aa28.22■■■□□ 2.11
RCAN3-211ENST00000630217 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.15■■■□□ 2.1
RCAN3-211ENST00000630217 KIF27Q86VH2 1401 aa28.14■■■□□ 2.1
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